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IBt-UNAMUnidad de Secuenciacion Masiva y Bioinformatica
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Archivo mensual: abril 2020
Fastp actualizado
Se instalo una nueva version de fastp, la 0.20.0. Que cuenta con algunas opcion nueva, como la de “merge”, con ” -m “. La documentación en linea se actualizo de la misma manera. ¡ Bonita cuarentena a tod@s ! … Sigue leyendo
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Instalación GapFiller
Se instalo GapFiller en el cluster. Es un programa para llenar los huecos entre contigs, durante un asembleo de novo. La documentación en linea indica el module adecuado a utilizar. ¡Feliz contingencia!
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Metaphlan
La version 2.96.1 de Metaphlan no contiene los script “utils”. Por ello se instalo la ultima version disponible que las contiene, la 2.7.7. Les pido revisar cuidadosamente las versiones que quisieran utilizar. El metodo empleado por los desarrolladores es un … Sigue leyendo
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