Archivo mensual: agosto 2022

Se actualizo la version de sra-tools a 3.0.0 . hempos encontrado algunos problemas con la version instalada actualmente 2.9.2. Una nota indica que para descargar fastq desde SRA, recomiendan utilizar fastqer-dump : https://github.com/ncbi/sra-tools/wiki/HowTo:-fasterq-dump Dejamos la version anterior por si alguien … Sigue leyendo →

Se actualizaron los archivos por “clados” : bacteria phage human fungi virus para nr (proteinas no redundantes de NCBI) y para los nucleotidos (nt). Los fasta por clados asi como los formateados para Blast 2.12.0.

Hola a todos. Se actualizo el dia de hoy las bases de datos de NCBI siguientes: nt nr pdbaa swissprot Tanto las bases de datos para Blast+, como los archivos Fasta correspondientes. Las bases de datos por clados (bacteria, fungi..) … Sigue leyendo →