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IBt-UNAMUnidad de Secuenciacion Masiva y Bioinformatica
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Archivo mensual: junio 2024
pharokka 1.7.2
Se instalo pharokka en el cluster, con su base de datos correspondiente. Pharokka es “a rapid standardised annotation tool for bacteriophage genomes and metagenomes.” Se define con el module la variable PHARODB que indica la ubicacion de la base de … Sigue leyendo
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SPades 4.0.0
Se instalo la ultima version de SPAdes 4.0.0: St. Petersburg genome assembler – a versatile toolkit designed for assembling and analyzing sequencing data from Illumina and IonTorrent technologies. Pueden encontrar mas informacion aqui .
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Qiime2 2024.5
Se instalo la última versión de Qiime2: 2024.5 : QIIME 2 is a powerful, extensible, and decentralized microbiome analysis package with a focus on data and analysis transparency. QIIME 2 enables researchers to start an analysis with raw DNA sequence … Sigue leyendo
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