Archivo mensual: agosto 2024

Ipyrad se instalo en el cluster, en su version 0.9.99. Es un programa para an interactive assembly and analysis toolkit for restriction-site associated DNA (RAD-seq) and related data types . Revisan la documentacion el linea para saber como utilizarlo!   … Sigue leyendo →

Gracias a Jorge Alexander Rojas Vargas por agradecer al cluster en su recientes articulos : Comprehensive comparative analysis of the periodontal pathogen Porphyromonas gingivalis: exploring the pan-genome, the reconstruction of the gene regulatory network and genome-scale metabolic network DOI:  y … Sigue leyendo →

Se instalo el programa VEP que permite predecir los efectos de SNPs. Este programa esta instalado via Singularity. chequen la documentacion del module para verificar como usarlo correctamente: $ module help programs/vep-112 Se instalo tambien el programa multiqc: “a reporting … Sigue leyendo →