subread 2.1.1

Se instalo en el cluster la herramienta:

The Subread package comprises a suite of programs for processing  next-gen sequencing data, in particular RNA-seq data.

Below are some of the functions provided by this package:

* Subread aligner: a general-purpose read aligner.

* Subjunc aligner: detecting exon-exon junctions and mapping RNA-seq reads.

* featureCounts: counting mapped reads for genomic features.

* exactSNP: a SNP caller that discovers SNPs by testing signals against local background noises.

Pueden encontrar mas informaciones: aquí .

 

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