Archivo del Autor: admin

Hola a todos. Se actualizo el dia de hoy las bases de datos de NCBI siguientes: nt nr pdbaa swissprot Tanto las bases de datos para Blast+, como los archivos Fasta correspondientes. Se actualizaron los archivos por “clados”, como bacteria, … Sigue leyendo →

Se realizaron las bases de datos formato Fasta y blast para los clados siguientes, extractos de nt y nt de ncbi: Bacterias Fungi Human Phage Virus Se encuentran en /scratch/DB y /scratch/BlastDB. Para mas informaciones, checan en cada directorio el … Sigue leyendo →

Hola a todos. Se actualizo el dia de hoy las bases de datos de NCBI siguientes: Betacononavirus nt nr patnt swissprot Tanto las bases de datos para Blast+, como los archivos Fasta correspondientes. Atte

Se actualizo la version de Interproscan a la : 5.51-85.0. La version anterior (5.45-80.0) se quedara disponible por 2 semanas mas, hasta el jueves 3 de junio, al menos que un usuario se comunique con nosotros para pedirnos que se … Sigue leyendo →

Se instalo la versión mas reciente de blast: 2.11.0. Revisen la documetacion en linea para saber cual module utilizar. Nos encontramos con el cluster en estado ya estable. En espera de recibir un nuevo master. Buen trabajo

El cluster esta en estado de reparación, luego de los percances electricos que sufrio en la semana del 8 de marzo. Lamentamos mucho esta situacion, pero les tendremos al tanto cuando este disponible y funcional el cluster. Debido a esta … Sigue leyendo →

Se actualizó las bases de datos nr, nt swissprot y Betacoronavirus para blast, como sus archivos fasta originales. La bases de datos para blast son en /scratch/BlastDB/. Los archivos Fasta son en /scratch/DB/ Cualquier duda sobre este tema preguntanos.

Se instalo la versión reciente de R (v4.0.3) en el cluster. Se utilza con el module programs/R-4.0.3. Los modulos instalados en la versión anterior estan normalmente actualizados en esta nueva versión. Si falta algunos, por favor reportenlos como siempre. Muy … Sigue leyendo →

El cluster cuenta con la version 2.2.0 de tensorflow, en su version para CPU unicamente. Existe dos versiones instaladas: la version precompilada instalada con pip la version compilada especialmente para los CPUs del cluster, que incluye las accelearciones SSE4, FNA … Sigue leyendo →

Esta mañana se actualizo la version del programa Diamond a la 2.0.4. Verifiquen la documentacion en linea para conocer el module adecuado a utilizar.