Teopanzolco

Se instalo la ultima version de GTDB-Tk :

a software toolkit for assigning objective taxonomic classifications to bacterial and archaeal genomes.

Revisan la documentacion en linea para conocer el module a utilizar.

Se actualizo la version 1.5.2 de SqueezeMeta. Seguramente se eliminara la version 1.3.0, mas antigua de este paquete.
Les avisaremos con tiempo de ello.

Se encendio un 3er nodo esta mañana , para aumentar a 3 el numero de nodos de calculo.
Estamos con revision por parte de mantenimiento del no-break de respaldo.

Cualquier duda avisanos por favor.

Se instalo la version mas reciente de Flye : De novo assembler for single molecule sequencing reads using repeat graphs .
El module para utilizarlo es programs/flye-2.9

Buen trabajo!

Hola a todos.

Estas 2 herramientas se instalaron en el cluster. Revisan por favor la docuemtnacion en linea para su utilizacion via los modules correspondientes.

Se instalo una version mas reciente de Signalp. la 5.0b. Les recuerdo que esta paqueteria se instala con licencia especifica para investigacion, como lo indica el archivo /share/apps/signalp-5.0b/signalp-5.0_license.txt.

Cualquier duda acuden con nosotros.

Atte

Se actualizaron los archivos por “clados” :bacteria, phage, human, fungi y virus, para nr (proteinas no redundantes de NCBI) y para los nucleotidos (nt). Los fasta por clados asi como los formateados para Blast 2.12.0.

Hola a todos.

Se actualizo el dia de hoy las bases de datos de NCBI siguientes:

• nt
• nr
• pdbaa
• swissprot

Tanto las bases de datos para Blast+, como los archivos Fasta correspondientes.

Se actualizaron los archivos por “clados” :bacteria, phage, human, fungi y virus, para NT (nucleotidos) y para NR (proteinas) Los fasta por clados asi como los formateados para Blast

Atte

Se instalo en Teopanzolco la última version de R : 4.1.2.
Esta disponible como todos los otros porgramas via el module correspondiente.

Que tengan un muy buen año 2022!

Atte

Hola a todos.

Se actualizo el dia de hoy las bases de datos de NCBI siguientes:

• nt
• nr
• pdbaa
• swissprot

Tanto las bases de datos para Blast+, como los archivos Fasta correspondientes.

Se actualizaron los archivos por “clados” :bacteria, phage, human, fungi y virus, para NT (nucleotidos) y para NR (proteinas) Los fasta por clados asi como los formateados para Blast

Atte